Données campagnes à la mer, océanographie opérationnelle, ressources biologiques ou entrepôt et catalogues de données

Date de création : 2020

Discipline(s) : Biologie, Droit (aspects juridiques)

Partenaires : Aucun

Projets associés : Aucun

Lien vers le portail : A ce stade d’avancement (phase1 terminée), le Système d’Information (SI) MORSE est un outil interne Ifremer qui ne peut être visualisé en externe.

Contact : morse@ifremer.fr 

Description : 

Le sujet de la traçabilité des échantillons biologiques s’est organisé en un projet structurant pour l’Institut nommé MORSE(Marine Organisms Resources Storage systEm).

En 2020, la coordination nationale APA  (Accès aux ressources génétiques et le partage juste et équitable des avantages découlant de leur utilisation) de l’Ifremer a recommandé la mise en place d’un système d’information qui soit capable de gérer, dans le temps et l’espace, la traçabilité des échantillons biologiques de l’institut afin de répondre aux obligations réglementaires notamment APA.

La première phase du projet, entre 2020 et 2024, a permis le déploiement à l’Ifremer d’une première interface du Si MORSE. Ce SI est conçu pour moissonner les informations de traçabilité dans les systèmes locaux de bancarisation d’Ifremer (voir figure ci-dessous). Il n’y a pas de ressaisies à effectuer.

LabCollector (système de gestion de l’information des laboratoire LIMS distribué par la société AgileBio) est un outil majeur pour le Système d'Information MORSE.

C'est en effet à partir des Instances LabCollector locales des laboratoires que MORSE réalise le moissonnage des métadonnées de traçabilité des échantillons qui sont ensuite importées dans le système central MORSE.

D'autres SI thématiques existants du Centre de Données de l'Ifremer (suivre ce lien http://data.ifremer.fr/Centre-de-donnees/Systemes-d-information pour en savoir plus) sont une source de métadonnées de traçabilité pour le SI MORSE : BIGOOD pour l'environnement profond, Harmonie pour l'halieutique, Quadrige pour l'environnement littoral.

L'objectif de moissonnage effectif de ces SI de référence est inscrit dans la feuille de route du SI MORSE.

Parmi les résultats de la première phase du projet, on recense :

–  Un inventaire des échantillons biologiques des laboratoires avec le recensement de plus de 500 000 échantillons bancarisés et de beaucoup d’échantillons historiques restant à numériser ;

– Un réseau de 40 correspondants locaux MORSE de 20 laboratoires Ifremer ;

– Un appui central à IRSI associé au déploiement du LIMS (Laboratory Information Management System) LabCollector au sein des laboratoires pour le suivi en particulier des échantillons biologiques, avec un socle traçabilité commun à tous les laboratoires ;

– Une interface utilisateur MORSE d'administration centralisée des informations nécessaires pour l’institut comprenant :

• les données de traçabilité des échantillons des laboratoires (sans ressaisie) ;
• les documents permettant d’assurer la conformité au niveau de l’APA avec des indicateurs de conformité associés ;

–  Une mise en conformité progressive des projets Ifremer concernés par l’APA :

• 47 projets mis en conformité APA depuis 2021 ;
• 52 projets en cours de mise en conformité ;
• 40 projets concernés par l’APA mais dont l’Ifremer n’est pas coordinateur ;