Nos systèmes d'information
Un Système d'Information, c'est quoi ?
C'est un système de gestion de données et services lié à ces données. Un système d'information est lié à une thématique de données. Il assure la collecte, le contrôle la qualité, l'archivage des données pour leur pérennisation.
Données campagnes à la mer
Date de création : 1995
Discipline(s) : Bathymétrie, sismique, gravimétrie et magnétisme
Partenaires : Tous les scientifiques utilisant les navires de la Flotte Océanographique Française
Projets associés : EMODnet Bathymetry, GEBCO, SeaBed 2030
Lien vers le portail : https://donnees-campagnes.flotteoceanographique.fr/
Contact : sismer@ifremer.fr
Description :Historiquement, la banque de géophysique contient les données acquises par les navires de l’Ifremer depuis les années 1980. Elle recueille actuellement les données bathymétriques, sismiques, gravimétriques et magnétiques acquises à bord des navires de la FOF telle que celle-ci existe depuis 2018. Cette base de données contient :
- les métadonnées des fichiers bruts d’acquisition (données d’observation à l’état de sortie des navires),
- les métadonnées des fichiers qualifiés de gravimétrie/magnétisme/bathymétrie verticale moyennés à la minute.
Le SISMER est chargé d’assurer l’archivage pérenne de ces données, l’indexation des méta-données en base de données et la rediffusion des fichiers de données dans le respect de la législation maritime internationale en vigueur (Convention de Montego Bay de 1982 notamment).
Les données sont transmises au SISMER par Genavir, armateur de la FOF, et sont affichées sur les portails des campagnes et des données environ 3 mois après la fin de chaque campagne océanographique.
Données campagnes à la mer
Date de création : 1993
Discipline(s) : Physique et chimie
Partenaires : Tous les laboratoires scientifiques utilisant les navires de la Flotte Océanographique Française
Projets associés : SeaDataNet, SeaDataCloud, EMODnet Chimie
Lien vers le portail : https://donnees-campagnes.flotteoceanographique.fr/
Contact : sismer-physique@ifremer.fr
Description : La banque nationale de Physique Chimie (BPC) assure l’exploitation des données in-situ de physique-chimie acquises lors des campagnes à la mer à bord des navires de la Flotte Océanographiques Française (FOF) qui ont été transmises en temps différé, après validation par les scientifiques responsables de leur collecte.
Les données validées peuvent arriver dans le BPC par deux flux :
- Filière classique : envoi direct des scientifiques,
- Systèmes de dépôt et de publication de données : Seanoe (national) & EMODnet Ingestion (européen).
L’exploitation de la BPC consiste à :
- Recueillir les données analysées par les scientifiques et acquises à bord des campagnes à la mer de la Flotte Océanographique Française (FOF),
- Formater les données aux standards nationaux et européens (Seadatanet),
- Qualifier les données en passant un contrôle qualité répondant à des normes internationales,
- Bancariser et archiver les données de façon pérenne,
- Diffuser les données en les rendant accessibles à des utilisateurs scientifiques ou privés,
- Répondre à des demandes de données de la part d’utilisateurs scientifiques ou privés.
Cette base de données contient des données de physique-chimie telles que température, salinité, oxygène, sels nutritifs, pigments chlorophylliens, système des carbonates, optique, séries temporelles de courantométrie, ADCP de coque, chaines de thermistance, marégraphes…
Ces données sont affichées sur les portails des campagnes et des données après les différentes étapes de l’exploitation validées.
Données campagnes à la mer
Date de création : 2015
Discipline(s) : géologie et biologie
Partenaires : Tous les laboratoires scientifiques utilisant les navires de la Flotte Océanographique Française
Projets associés : IGSN - L’Ifremer est membre de l’association internationale IGSN - International Generic Sample Number depuis 2017, pour l’identification unique d’échantillons physiques.
Lien vers le portail : https://echantillons.ifremer.fr/
Contact : sismer@ifremer.fr
Description :BIGOOD est une base de données d'échantillons biologiques et géologiques (BIology and GeOlogy Ocean Database) créée en 2015 et issue de la fusion de la Banque de Géophysique et Géologie marine et de la base de données BIOCEAN pour l’environnement profond. Elle regroupe les descriptions d’échantillons biologiques et géologiques relatives aux prélèvements effectués par les équipes et/ou moyens Ifremer ou conservés à l’Ifremer :
- campagnes de prélèvement en mer ;
- stations d’observation et de prélèvement : position, type d’observation et de prélèvement (submersible, forage, dragage, mouillage);
- description et localisation précise de stockage des échantillons pour les données géologiques.
- Analyses associées: chimie, granulométrie (Folk, laser), stratigraphie, lithologie, mesures par Multi-Sensor Core Logger
Elle peut également contenir certaines analyses associées réalisées à partir des échantillons : analyses chimiques, granulométriques, stratigraphiques, lithologiques ou mesures par exemple.
La base de données BIGOOD est un sous ensemble de tables de la base de données du catalogue des campagnes hébergé au SISMER. Les échantillons sont géo référencés et associés aux opérations à la mer ayant permis le prélèvement (par exemple bennes, dragues, carottiers, forages, prélèvements en submersible, etc..).
L’import des données se fait après les campagnes, à partir du logiciel Sealog (échantillons biologiques) utilisé à bord, ou Archimède (échantillons géologiques) utilisé à terre. Les données stockées dans BIGOOD sont exportées vers portails nationaux et européens comme la cyber-carothèque nationale pour les prélèvements de type carotte sédimentaires et SeaDataNet pour les analyses issues d’échantillons géologiques, et des des bases internationales comme le GBIF et OBIS pour les échantillons biologiques.
Données campagnes à la mer
Date de création : 2016
Discipline(s) : Métadonnées des campagnes
Partenaires : Tous les laboratoires scientifiques utilisant les navires de la Flotte Océanographique
Projets associés : Sans objets
Lien vers le portail : https://campagnes.flotteoceanographique.fr/
Contact : sgc@flotteoceanographique.fr
Description :
Le catalogue des campagnes océanographiques recense toutes les campagnes qui se sont déroulées sur les navires français (opérés par la Direction de la Flotte Océanographique) ou en coopération sur des navires étrangers.
Ce catalogue contient actuellement plus de 10200 campagnes et s'enrichit chaque année d’environ 200 nouveaux résumés de campagnes, la plus ancienne datant de 1909. Une recherche est possible, selon différents critères, à l’aide des facettes et des zones de recherche. Il est également possible d’exporter les résultats de ces recherches grâce à l’outil d’export disponible.
Pour chaque campagne, une page regroupe un ensemble d’informations d’origines diverses : La description de la campagne et des travaux réalisés, mais également les données archivées au SISMER, la bibliographie, les jeux de données publiés, les éventuelles vidéos et la valorisation associés à cette campagne.
Données océanographie opérationnelle satellite
Date de création : 2012
Discipline(s) : humidité des sols, VOD, précipitation, cryosphère, salinité, température de brillance
Projets associés : Copernicus Marine Service, CERSAT
Lien vers le portail : https://www.catds.fr/
Contact : support@catds.fr
Description :
Le Centre Aval de Traitement des Données SMOS (CATDS), développé par le CNES en collaboration avec le CESBIO, le LOCEAN et l'IFREMER, est dédié à :
- Produire et distribuer des produits SMOS L3/L4
- Retraiter au besoin les produits L3/L4
- Développer, tester et valider les algorithmes des chaines de traitement L3/L4
- Proposer des améliorations des chaines de traitement L1/L2
- Fournir services et support aux utilisateurs des produits
La mission SMOS (Soil Moisture and Ocean Salinity) est un programme conjoint d'observation de la Terre ESA/CNES/CDTI. Le satellite SMOS a été lancé le 2 novembre 2009.
L'objectif de la mission SMOS est de fournir des cartes d'humidité du sol (SM) et de salinité des océans (OS). SM et OS sont des variables clés dans la surveillance du climat, les transferts surface/végétation/atmosphère et les cycles océan/atmosphère.
SISMER et ISI sont impliqués dans la gestion du Data Production Centre (CPDC) chargé de produire et de diffuser de manière régulière des données de niveau L3 et L4 (à partir des données SMOS L1B fournies par ESA DPGS). Le CPDC est établi à l’Ifremer de Brest, il est coordonné par le CNES, l’IFREMER, le CESBIO et le LOCEAN.
Plus d’informations sur : https://www.catds.fr
Données océanographie opérationnelle satellite
Date de création : 1991
Discipline(s) : température de surface de la mer, salinité de la surface de la mer, vents marins, couleur de l'océan, glace de mer, flux thermique océanique et vagues
Partenaires : CNES, ESA, NOAA, NASA, ISRO, Météo France et EUMETSAT
Projets associés : CATDS, CFOSAT, Sentinel1, SMOS Wind, OSI SAF, Copernicus Marine Service et PiMEP salinity
Lien vers le portail : https://cersat.ifremer.fr/
Contact : cersat@ifremer.fr
Description: Le CERSAT est le centre de traitement et de distribution des données satellitaires de l'Ifremer, soutenu par :
- Le Laboratoire d'Océanographie Physique et Spatiale (LOPS), qui apporte son expertise pour le développement et l'analyse de produits scientifiques innovants de télédétection
- Le SISMER (Système d'Information Scientifique pour la Mer), qui soutient le traitement et la diffusion des produits de données scientifiques du CERSAT.
Les jeux de données fournis par le CERSAT permettent de décrire l'état de l'océan et les interactions air-mer, de suivre l'évolution et l'impact de variables essentielles sur le système climatique mondial. Ils proviennent de chaînes de traitement développées et exploitées en interne ou par des entités associées, telles que Météo-France/CMS et dans le cadre de nombreux projets nationaux et internationaux soutenus par Copernicus, le CNES, l'Agence Spatiale Européenne (ESA) ou EUMETSAT. Cela va de données fournies en temps quasi réel à des séries chronologiques longues et homogènes de variables climatiques essentielles.
A l'échelle nationale, le CERSAT est l'un des Centres de Données et Services du pôle national ODATIS, le réseau fédéré français pour les données d'observation de l'océan.
Données océanographie opérationnelle In situ
Date de création : 2001
Discipline(s) : océanographie physique, biogéochimie et océan global
Partenaires : CNES, CNRS, IPEV, IRD, Météo France, SHOM, Ifremer, COAST-HF et Céréma
Projets associés : EOSC, FAIR-EASE, Copernicus Marine In Situ Tac, One Argo
Lien vers le portail : https://www.coriolis.eu.org/
Contact : codac@ifremer.fr
Description: Coriolis a débuté en 2001 en tant que programme pilote et s'est rapidement transformé en une infrastructure opérationnelle en 2009 grâce à son extension aux données côtières utilisées par les modèles de façade Mercator-Océan et au maintien de réseaux d'observation in-situ tels que Argo, Pirata, SSS ou les bouées dérivantes.
Coriolis a pour but d'exploiter et de faire évoluer une structure pour l'acquisition, la collecte, la validation et la diffusion de données in situ en temps réel et en différé pour l'océan mondial. Les observations mesurent principalement les paramètres physiques : température, salinité et vitesse sous forme de profils ou de sections à résolution verticale ou horizontale, et de séries temporelles. Mais des paramètres biogéochimiques peuvent également être mesurés par des plateformes autonomes, tels que la chlorophylle ou l'oxygène.
Coriolis est une composante de l'océanographie opérationnelle française et européenne qui s'articule avec Mercator-Océan et le Service Marin Copernicus. Il contribue à Argo et GODAE OceanView et fournit régulièrement des données à plusieurs systèmes nationaux. Outre sa contribution à l'océanographie opérationnelle, Coriolis a également initié la base de données nécessaire à l'étude de la variabilité climatique envisagée dans le cadre des programmes CLIVAR.
Données ressources biologiques et laboratoires
Date de création : 1982
Discipline(s) : Halieutique
Partenaires : DGAMPA, ICES
Projets associés : SACROIS, DELMOGES, OBSCME, RECOPESCA, ACCOBIOM
Lien vers le portail : https://sih.ifremer.fr/
Contact : harmonie@ifremer.fr
Description:Le Système d’Informations Halieutiques (SIH) est un réseau pérenne, opérationnel et pluridisciplinaire d’observation des ressources halieutiques (c’est-à-dire concernant la pêche) et des usages associés à usage scientifique. Il est complémentaire mais distinct du Système d’Information Pêche et Aquaculture (SIPA) de la Direction Générale des Affaires Maritimes, de la Pêche et de l’Aquaculture (DGAMPA).
Harmonie est un système de gestion de données unique, mutualisé, réceptacle de l’ensemble des données halieutiques collectées ou bancarisées par le Système d’Informations Halieutiques.
L’objectif principal d’Harmonie est de mettre à disposition de la communauté scientifique un véritable outil d’analyse intégré de la filière, pour les travaux de recherche, d’évaluation et d’expertise conduits notamment en soutien aux politiques publiques.
Ainsi, Harmonie permet de :
- Mettre en cohérence les données, via des référentiels et des procédures harmonisées, améliorer la qualité d’ensemble des données
- Favoriser l’intégration de données provenant d’autres systèmes d’informations (notamment le SIPA de la DGAMPA)
- Factoriser et mutualiser les développements, optimiser les différentes fonctions (sauvegarde, intégrité et pérennité, contrôle/qualification, valorisation et diffusion des données)
- Rationaliser l’exploitation des données (service continu)
Les données bancarisées permettent d’étudier : les écosystèmes, les ressources exploitées, les débarquements et efforts de pêche, l’activité de pêche et les répercussions socio-économiques. Ces données proviennent de programmes de collecte (ObsMer, ObsDeb, …), de campagnes halieutiques et de flux de données transmis par la DGAMPA.
Le rôle du centre de données est d’assurer le bon fonctionnement de l’exploitation du système Harmonie en collaboration avec la maîtrise d’ouvrage (RBE-HISSEO) et la maîtrise d’œuvre (IRSI-ISI).
Données campagnes à la mer, océanographie opérationnelle, ressources biologiques ou entrepôt et catalogues de données
Date de création : 2020
Discipline(s) : Traçabilité des ressources biologiques, obligations réglementaires, APA, transferts de matériel biologique,
Partenaires : Aucun
Projets associés : Tous les projets Ifremer au sens de SAP et concernés par l’APA
Lien vers le portail :https://morse-data.ifremer.fr/
Contact : morse@ifremer.fr
Description :
En 2019, la coordination nationale APA (cellule interne à l’Ifremer) a recommandé la mise en place d’un système d’information qui soit capable de gérer, dans le temps et l’espace, la traçabilité des échantillons biologiques afin de répondre aux obligations réglementaires APA (Accès aux ressources génétiques et le partage juste et équitable des avantages découlant de leur utilisation). Cependant, un besoin réglementaire plus large est apparu. Certains échantillons (ou ressources biologiques) ne sont pas concernés par la réglementation APA mais peuvent être soumis à d’autres réglementations telles que la CITES (Convention sur le commerce international des espèces de faune et de flore sauvages menacées d’extinction), les obligations douanières, zoo-sanitaires, etc… Les financements européens exigent également de plus en plus un haut niveau de traçabilité et de partage à la communauté scientifique. C’est dans ce contexte que le système d’information MORSE (Marine Organisms Resources Storage systEm) a été mis en place afin de gérer la traçabilité, dans le temps et l’espace, de tous les échantillons biologiques conservés par l’Ifremer. Les principaux objectifs du SI MORSE sont les suivants :
- Répondre aux finalités réglementaires (APA, CITES, Obligations douanières) ;
- Bancariser les informations de traçabilité minimales et gérer la filiation entre les échantillons ;
- Importer, sans ressaisie, les informations de traçabilité déjà présentes dans les systèmes de bancarisation usuels de l’Ifremer ;
- Identifier et localiser de manière certaine un échantillon biologique ;
- Identifier des échantillons sous propriétés d’Ifremer ;
- Partager en interne et en externe les collections en conformité avec les législations ;
- Rechercher facilement une série d’échantillons.
Données campagnes à la mer
Date de création : 2017
Discipline(s) : Cycle de vie des campagnes
Partenaires : Direction de la Flotte Océanographique Française (FOF), scientifiques responsables de campagnes (chef de missions) à l’Ifremer ou hors Ifremer, commissions nationales hauturières et côtières, scientifiques experts
Projets associés : Sans objets
Lien vers le portail : https://sgc.flotteoceanographique.fr/
Contact : sgc@flotteoceanographique.fr
Description :
Les campagnes à la mer réalisées sur les navires de la Flotte Océanographique Française (FOF) sont gérées dans le Système de Gestion des Campagnes (SGC). Ce système d’information aide les différents acteurs dans le cycle de vie des campagnes grâce à une interface unique, accessible à l’ensemble de ces acteurs, et en centralisant toutes les informations de la campagne dans une base de données unique.
Pour accéder au SGC, il est nécessaire d’avoir un compte Extranet Ifremer actif (en cas de besoin, contacter sgc@flotteoceanographique.fr).
La bancarisation des Campagnes par le Centre de Données pré-existait au SGC, depuis 1990 (année de création du SISMER).
Jusqu’en 2019, le Centre de Données réalisait les bilans annuels des campagnes océanographiques françaises et les diffusait largement à la communauté scientifique internationale (Versions française et anglaise disponibles). Ces bilans sont disponibles sur Archimer au format numérique pour les années 2007 à 2019. Pour les versions plus anciennes, elles n’étaient disponibles qu’au format papier.
Depuis 2020, la Direction de la Flotte Océanographique (DFO) a pris le relais en publiant les rapports annuels d’activité de la FOF. Ces rapports sont accessibles sur le site :
https://www.flotteoceanographique.fr/Nous-connaitre/Rapports-et-publications/Rapports-d-activites
Entrepôt et catalogue de données
Date de création : 2015
Discipline(s) : Sciences marines
Partenaires : Pôle Océan ODATIS
Projets associés : SeaDataNet
Lien vers le portail :https://www.seanoe.org/
Contact : data@seanoe.org
Description:
SEANOE (SEA scieNtific Open data Edition) est un entrepôt de données scientifiques marines. SEANOE est opéré par le SISMER dans le cadre du Pôle national Odatis.
Les données publiées par SEANOE sont accessibles gratuitement. Elles peuvent être utilisées en respectant les conditions de la licence Creative Commons sélectionnée par l’auteur des données.
SEANOE contribue au mouvement Open Access / Open Science pour un accès libre à tous des données scientifiques financées par des fonds publics, au bénéfice de la recherche.
De façon exceptionnelle, un embargo limité à 2 ans sur un jeu de données est possible ; par exemple pour restreindre l’accès aux données d’une publication en cours de revue scientifique.
Chaque jeu de données publié par SEANOE bénéficie d’un DOI qui lui permet d’être cité dans une publication de manière fiable et pérenne.
La préservation à long terme des données déposées dans SEANOE est assurée par les infrastructures informatiques de l’Ifremer.
Entrepôt et catalogue de données
Date de création : 2001
Discipline(s) : Bathymétrie européenne, habitats physiques, granulats marins, hyperspectrale (la réunion), échantillons marins, données des navires (géophysique), ADCP des navires (courants) et typologie des habitats (Nouvelle-Calédonie)
Partenaires : Ministère (DEB)
Projets associés :Copernicus Marine In Situ TAC, EMODnet, ODATIS, DCSMM, et DATA TERRA
Lien vers le portail : https://sextant.ifremer.fr/
Contact : sextant@ifremer.fr
Description:
Infrastructure de Données Géographiques (IDG) marines et littorales, Sextant a pour objectif de documenter, diffuser et promouvoir un catalogue de données relevant du milieu marin.
A destination des laboratoires et des partenaires de l’Ifremer, ainsi que des acteurs nationaux et européens œuvrant dans le domaine marin et littoral, Sextant fournit des outils favorisant et facilitant l’archivage, la consultation et la mise à disposition de ces données géographiques.
Données campagnes à la mer, océanographie opérationelle, ressources biologiques ou entrepôt et catalogues de données
Date de création : 2015
Discipline(s) : Vidéos
Partenaires :
Projets associés :
Lien vers le portail : https://video.ifremer.fr/
Contact : sismer@ifremer.fr
Description :
Ce portail a pour objectif de donner accès aux données vidéos et images acquises au cours des plongées des engins sous-marins de l'Ifremer (Engins actuels mettant en œuvre de l’imagerie : Ariane, Victor 6000, Nautile ; Engins anciens : Cyana, Sar,) mais également d’engins d’équipes scientifiques (Engins actuels : Pagure, Scampi ; Engins anciens : Deeptow, Shinkai).
Les vidéos et images diffusées à travers ce portail sont organisées par campagne océanographique, par engin sous-marin, par plongée et par caméra. Ces données sont accompagnées par des métadonnées relatives aux plongées des engins sous-marins et aux conditions d'acquisition : positionnement et attitude de l'engin, données de température et salinité, position et paramétrage de la caméra. Les commentaires enregistrés en parallèle du tournage vidéo sont également accessibles lorsqu'ils existent.
Ce portail est amené à évoluer afin de permettre de pouvoir intégrer d’autres vidéos et images (nouveaux engins, observatoires et autres vidéos au point fixe (Ex : Staviro), etc.).